Τα
πρωτόζωα ζουν ελεύθερα στο έδαφος και
τρέφονται με διαλυτές οργανικές ουσίες
και μικροοργανισμούς. Στο έδαφος,
συνηθέστατα παρατηρείται σχέση άρπαγα
- λείας μεταξύ πρωτόζωων και βακτηρίων,
ιδιαίτερα κοντά στις ρίζες των φυτών,
το οποίο συνεισφέρει πολύ στον ρυθμό
επαναφοράς των βακτηριακών πληθυσμών.
Η βοσκή των πρωτόζωων πάνω σε γερασμένες
αποικίες βακτηρίων διατηρεί τους
πληθυσμούς των βακτηρίων φυσιολογικά
νεαρούς και άρα, πιο δραστήριους στην
αποικοδόμηση των οργανικών ουσιών και
την ανακύκλωση των θρεπτικών στοιχείων.
Επίσης, η μεγάλη κινητικότητα των
πρωτόζωων στο νερό του εδάφους είναι
πιθανό να προμηθεύει τα βακτήρια με
αυξημένες ποσότητες διαλυτού οξυγόνου
και θρεπτικών ουσιών (Burns και Martin 1986).